[ruby-list:50509] Re: plotutils required で落ちてしまいます。
From:
konami <konami@...>
Date:
2017-03-31 03:35:40 UTC
List:
ruby-list #50509
斎藤さん,わざわざ調べていただきありがとうございます。 graph コマンドが実行できるのでおかしいと思っていましたが,インストールの 順序に問題があったわけですね。 先に plotutils をインストールしてから, gem で gsl を入れるという順序で いくべきということで plotutils はすでにインストールされているので, gem uninstall gsl gem install gsl としただけで,スクリプトが走ってグラフが生成できました。ありがとうございま す。勉強になりました。 小波秀雄 On 2017年03月31日 09:47, Tadashi Saito wrote: > 斎藤と申します。 > > 調べてみました。結論からすると、スクリプト実行時ではなく、 > gsl gemをビルド・インストールする「前に」plotutil > (具体的にはgraphコマンド)をインストールする必要がありそうです。 > > エラーメッセージが出たのはこの辺りだと思うのですが、 > https://github.com/SciRuby/rb-gsl/blob/master/ext/gsl_native/graph.c#L1225 > これを出さないためには HAVE_GNU_GRAPH がdefineされてる必要が > あります。それでどういう条件でdefineされてるか、extconfを見ると > https://github.com/SciRuby/rb-gsl/blob/master/ext/gsl_native/extconf.rb#L146 > とあり、どうもビルド時にgraph(1)がないとコンパイルされるコードが > 変わってしまうのだな、というのが分かります。 > > しかし(エラーメッセージと相まって)他にもハマる人が出そう > なので、 > > ・エラーメッセージに "when built" とかを足す(楽なコース) > ・graphコマンドのチェックをビルド時でなく実行時に移動させる > (本質的なコース) > > というようなPull Requestを送ると、みんな幸せになれて良いのでは > ないか、と感じました。 > > 2017年3月30日(木) 14:10 konami <konami@kyoto-wu.ac.jp > <mailto:konami@kyoto-wu.ac.jp>>: > > 小波です。 > > Bootstrap という 多数回のサンプリングを繰り返す統計計算があり, > それを Ruby/GSL でやってみようと思ってこの間から格闘しています。 > > その中で,ヒストグラム作成の処理のために Histogram > クラスを利用しようと > 次のソースを走らせてみましたが,その下のようなエラーを吐いてしまいます。 > ------------------------------------------------------ > #! /usr/bin/env ruby > require "gsl" > include GSL > N = 10000 > MAX = 8 > rng = Rng.alloc > > data = Ran.gaussian(rng, 1.5, N) + 2 > h = Histogram.alloc(100, [-MAX, MAX]) > h.increment(data) > > sigma, mean, height, = h.fit_gaussian > x = Vector.linspace(-MAX, MAX, 100) > y = height*Ran::gaussian_pdf(x-mean, sigma) > GSL::graph(h, [x, y], "-T X -C -g 3") > #出典: > #http://blackwinter.github.io/rb-gsl/rdoc/hist_rdoc.html > --------------------------------------------------- > > ./gsltest.rb:15:in `graph': GNU plotutils required (NoMethodError) > from ./gsltest.rb:15:in `<main>' > > ちなみ, plotutils, lipplot-dev はインストールされています。 > 何かヒントをいただけると幸いです。 > > 小波秀雄 > > -- > 斎藤 匡